产品介绍
由中国现代海产品物理学的论述院所生物体能力的论述中心局李炯棠的论述团对协力与重庆康普森占农业的大部分科技我司现有我司开拓没事款适当于鲤培育、品系判定等二主要用途的dna制种集成ic
——“鲤育1号”(图2)。该集成ic包函了20K个超高产品质量量的SNP位点,为青鱼流通业提质提产,培育优越、超高产、耐粗、高抗、耐密等优异的相对性状的青鱼优良品种提高有利的能力的支撑。
“鲤育1号”主要采用康普森CAGT(®)靶向药物捕捉到测序枝术,内含16种主养理鱼的全遗传基因组遗传组重测序遗传变异和核心生活物理性质关联关系标示。“鲤育1号”集成块位点包裹全遗传基因组遗传组首选生物制种反应大的位点和包扩各种理鱼消费者多态性标示。该集成块内含理鱼膳食纤维品控物理性质(粗球蛋白、粗肌堆积、碳水化合物、肌堆积酸、肌质构、肌间刺、纹段等)、静脉血化学成分及占比、年龄等物理性质的碳原子标示18056个,除此以外还包扩分清16种鲤新木种非特异聊天位点144个,也可以于核心物理性质的生物制种值加权评均值和新木种确权呵护。凭借模本集成块测试图片,“鲤育1号”集成块,护肤品位点检测率高,评均检测率做到了95.18%,护肤品比较稳定义好、遗传基因组遗传型合理高,按顺序模本评均分析完全一致比率98.77%,护肤品安全性能优良率。
|
软件讯息
|
的关键数据
|
“鲤育二号”繁育处理器
|
|
箭头短信
|
标记符号型号
|
SNP
|
|
标记图片总人数
|
20359
|
|
鲤鱼营养品质性状、血液成分及含量、 性别等性状功能位点
|
18056
|
|
木种鉴定结论位点
|
144
|
|
科技方式
|
康普森CAGT®靶向药物阻止测序技能
|
|
分类基因遗传组
|
GCF_018340385.1
|
数据表现
“鲤育一号”— 染色体分布情况
鲤鱼(Cyprinus carpio)作为异源四倍体鱼类,各由25条染色体组成。该芯片囊括了A亚基因组和B亚基因组的鲤亚基因组水平的变异,为在四倍体背景下开展重要经济性状遗传解析,进行基因组选择育种技术创新提供了新的视野。
图1 芯片位点在染色体上(A基因组和B基因组)的分布图
“鲤育一号”育种芯片 — MAF分布
图2 芯片位点MAF分布
“鲤育一号”育种芯片 — 位点注释情况
图3 芯片位点注释情况
“鲤育一号”育种芯片 — 分型一致性
图4 重复样本分型一致性
通过对3组重复样本进行分型,显示平均一致率达98.77%。
以上结果表明,鲤育一号位点选择合理、变异丰富、一芯多用(育种、品种鉴定、功能位点因果检测),芯片设计出众,分型结果表现优异,能够满足大量样本的检测需求。