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基因组重测序
低深度重测序
低深度重测序
简要概述
全人类dna基因组组低淬硬层重测序（Low coverage WGS，LcWGS）指的是回收利用较低淬硬层（~1×）的重测序大数据资料表格做好显性人类dna基因人类dna基因突变临床表现，最后凭借人类dna基因组型补充，将低体积孔隙率大数据资料表格补充为高体积孔隙率人类dna基因组型大数据资料表格。LcWGS 不要设计開發，测序成本以及消耗低低，会更改全人类dna基因组组显性人类dna基因人类dna基因突变，更极为有立于大投资额样板的物理性质确定及 GS 选育用。
应用场景
01. 性状定位
动植物全基因组关联分析
02. 遗传评估
动植物全基因组选择育种
技术优势
  • 变异信息
    丰富
    可兑换全人类基因组的隔代遗传变种
  • 高性价比
    以越来越低的测序费用低，拿到高导热系数的标识，加测转化率高
  • 大群体
    样本检测
    适用性于大消费者的dna型查测及研发
  • 分型
    准确性高
    系统设计补充聚类算法，临床表现准确性率高达98%
技术流程
优秀案例
低深度重测序--猪胴体分割性状及形态性状的遗传解析与基因组预测
本研究测定了长白、大白、长大二元以及杜长大三元猪4个群体的2,012头猪的17个分割肉性状和14个胴体性状。使用单倍型GWAS分析和基于基因型填充数据的GWAS分析分别鉴定到14个和112个与胴体分割性状极显著相关的QTLs。利用“中芯一号”芯片检测数据和基因型填充数据对这四个不同群体的分割肉性状和胴体性状进行全基因组选择研究。比较不同基因型数据、不同群体、以及不同预测模型对基因组预测准确性的影响。
图1 GWAS遗传性状产品定位及GS然而相当
参考文献
Xie, L., Qin, J., Rao, L., Cui, D., Tang, X., Chen, L., Xiao, S., Zhang, Z., & Huang, L. (2023). Genetic dissection and genomic prediction for pork cuts and carcass morphology traits in pig. Journal of animal science and biotechnology, 14(1), 116.
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