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基因组重测序
低深度重测序
低深度重测序
简要概述
全什么是表观基因组低厚度重测序(Low coverage WGS,LcWGS)指的是去较低厚度(~1×)的重测序的动态数据资料去基因性基因突变临床表现,后来经过什么是表观基因型自动选中,将低硬度的动态数据资料自动选中为高硬度什么是表观基因型的动态数据资料。LcWGS 不能不平台開發,测序投资低廉,要能调用全什么是表观基因组基因性基因突变,更方便于大市场规模范本的遗传性状市场定位及 GS 生物育种软件。
应用场景
01. 性状定位
动植物全基因组关联分析
02. 遗传评估
动植物全基因组选择育种
技术优势
  • 变异信息
    丰富
    可拿到全遗传基因基因组的遗传基因进化
  • 高性价比
    以非常低的测序代价低,提升致密单位的标上,探测效果高
  • 大群体
    样本检测
    适宜于大社会群体的基因组型检侧及调查
  • 分型
    准确性高
    鉴于添加优化算法,临床表现精确率能达到98%
技术流程
优秀案例
低深度重测序--猪胴体分割性状及形态性状的遗传解析与基因组预测
本研究测定了长白、大白、长大二元以及杜长大三元猪4个群体的2,012头猪的17个分割肉性状和14个胴体性状。使用单倍型GWAS分析和基于基因型填充数据的GWAS分析分别鉴定到14个和112个与胴体分割性状极显著相关的QTLs。利用“中芯一号”芯片检测数据和基因型填充数据对这四个不同群体的分割肉性状和胴体性状进行全基因组选择研究。比较不同基因型数据、不同群体、以及不同预测模型对基因组预测准确性的影响。
图1 GWAS遗传性状准确定位及GS结果显示相对比较
参考文献
Xie, L., Qin, J., Rao, L., Cui, D., Tang, X., Chen, L., Xiao, S., Zhang, Z., & Huang, L. (2023). Genetic dissection and genomic prediction for pork cuts and carcass morphology traits in pig. Journal of animal science and biotechnology, 14(1), 116.
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